Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SUCLG2Q96I99 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SUCLG2Q96I99 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms