Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC10A4Q96EP9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC10A4Q96EP9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms