Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMTM5Q96DZ9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms