Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAF2Q96CS3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms