Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VOPP1Q96AW1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VOPP1Q96AW1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms