Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC102AQ96A19 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC102AQ96A19 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms