Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPTSSAQ969W0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTSSAQ969W0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms