Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GATA6Q92908 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GATA6Q92908 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GATA6Q92908 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GATA6Q92908 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms