Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP6NLQ92738 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6NLQ92738 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms