Protein–RNA interactions for Protein: Q92597

NDRG1, Protein NDRG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG1Q92597 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDRG1Q92597 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDRG1Q92597 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms