Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SSMEM1Q8WWF3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SSMEM1Q8WWF3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms