Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX29Q8TEQ0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms