Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACER1Q8TDN7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACER1Q8TDN7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ACER1Q8TDN7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms