Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KLHDC4Q8TBB5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHDC4Q8TBB5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms