Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO3Q8TAP4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO3Q8TAP4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms