Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC148Q8NFR7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC148Q8NFR7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms