Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CMTR1Q8N1G2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CMTR1Q8N1G2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms