Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP4Q86YS3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB11FIP4Q86YS3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms