Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDXQ7Z353 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDXQ7Z353 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms