Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
OTOP1Q7RTM1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTOP1Q7RTM1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms