Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY3Q7L099 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY3Q7L099 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms