Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMUB2Q71RG4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMUB2Q71RG4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms