Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP53Q70EK8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP53Q70EK8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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