Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC149Q6ZUS6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC149Q6ZUS6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms