Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC00299Q6ZSB3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC00299Q6ZSB3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms