Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms