Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCE2Q6PIF2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYCE2Q6PIF2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms