Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KANK3Q6NY19 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KANK3Q6NY19 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms