Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRPF40BQ6NWY9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRPF40BQ6NWY9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms