Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGMBQ6NW40 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGMBQ6NW40 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGMBQ6NW40 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms