Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
INTS3Q68E01 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms