Protein–RNA interactions for Protein: Q5U623

ATF7IP2, Activating transcription factor 7-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IP2Q5U623 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATF7IP2Q5U623 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATF7IP2Q5U623 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms