Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZFYVE27Q5T4F4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZFYVE27Q5T4F4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms