Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CEP170Q5SW79 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CEP170Q5SW79 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms