Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNT1Q5JUK3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNT1Q5JUK3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms