Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GLE1Q53GS7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLE1Q53GS7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms