Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARHGAP29Q52LW3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARHGAP29Q52LW3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms