Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTLL9Q3SXZ7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TTLL9Q3SXZ7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms