Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
QSER1Q2KHR3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
QSER1Q2KHR3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms