Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IMPG1Q17R60 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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