Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHQ16836 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHQ16836 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHQ16836 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHQ16836 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHQ16836 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHQ16836 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHQ16836 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHQ16836 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHQ16836 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHQ16836 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HADHQ16836 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HADHQ16836 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HADHQ16836 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HADHQ16836 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHQ16836 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHQ16836 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHQ16836 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHQ16836 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHQ16836 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHQ16836 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHQ16836 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHQ16836 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHQ16836 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHQ16836 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHQ16836 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHQ16836 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HADHQ16836 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHQ16836 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHQ16836 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHQ16836 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHQ16836 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHQ16836 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHQ16836 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHQ16836 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHQ16836 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHQ16836 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHQ16836 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HADHQ16836 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HADHQ16836 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHQ16836 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHQ16836 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHQ16836 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHQ16836 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHQ16836 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHQ16836 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHQ16836 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHQ16836 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHQ16836 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HADHQ16836 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms