Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SGCBQ16585 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SGCBQ16585 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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