Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRNP35Q16560 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRNP35Q16560 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
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