Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LAMA4Q16363 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LAMA4Q16363 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
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