Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATP6AP1Q15904 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms