Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIP4Q15650 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIP4Q15650 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms