Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LAPTM4AQ15012 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LAPTM4AQ15012 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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