Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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ITGA9Q13797 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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ITGA9Q13797 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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ITGA9Q13797 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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ITGA9Q13797 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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ITGA9Q13797 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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ITGA9Q13797 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA9Q13797 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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ITGA9Q13797 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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ITGA9Q13797 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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ITGA9Q13797 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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ITGA9Q13797 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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ITGA9Q13797 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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ITGA9Q13797 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA9Q13797 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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