Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRR1Q13601 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRR1Q13601 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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