Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAMK2DQ13557 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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